非洲拥有独特的地方家猪资源，主要分布在撒哈拉以南非洲地区。这些家猪长期适应散养模式，表现出良好的耐粗饲性与热带环境适应性。值得注意的是，部分群体可携带非洲猪瘟病毒而不表现临床症状，显示出潜在抗病性，使其成为热带品种改良与抗病育种的宝贵遗传资源。然而，外来品种引入与生产方式变化正导致其遗传资源衰退，部分种群濒临灭绝，相关研究与保护仍显不足。

中-非中心昆明动物研究所团队团队长期开展非洲农业动物资源的保护与利用研究。通过联合坦桑尼亚索科因农业大学、冈比亚西非家畜创新中心、尼日利亚国家兽医研究所、国际家畜研究所，以及国内崖州湾国家实验室和华中农业大学等机构，对来自非洲及欧亚大陆的千余份家猪样本开展了线粒体DNA（mtDNA）与Y染色体遗传标记分析，系统阐述了非洲家猪复杂的遗传起源与混合历史。

母系遗传的mt DNA分析显示，非洲家猪血统主要由东亚（约53.3%）和欧洲（约44.8%）家猪成分构成，在坦桑尼亚群体中还发现了罕见的亚洲野猪血统（约1.9%）。父系遗传的Y染色体信息进一步证实欧洲血统占主导地位（图1）。这表明非洲家猪基因库是由多次、多方向的人类活动共同塑造的结果。

图1. 非洲地方家猪的mtDNA和Y染色体分析揭示混合起源

研究团队进一步整合考古学与历史学证据，发现西非及部分东非猪的特定母系世系E2与伊比利亚半岛家猪密切相关，其分化时间可追溯至约4500年前（图2）。这暗示家猪可能在全新世中期随农业扩散或人群迁徙从欧洲经北非进入非洲大陆。该欧洲血统世系从西非向东非的扩散，在时空上与著名的“班图人扩张”高度吻合，表明猪作为生计资产曾伴随这次重大人类迁徙事件。而在东非沿海占主导的东亚家猪血统，则很可能与印度洋贸易及殖民时期的引种活动有关，见证了非洲与亚洲之间悠久的经济文化往来。

图2. 非洲家猪伴随农业人群以及其他驯化动植物迁移扩散

该研究不仅从遗传学层面解答了非洲家猪起源与扩散这一长期科学问题，也凸显了非洲本土畜禽资源作为独特遗传宝库的重要价值。这为后续挖掘与利用其抗病、适应性状相关基因奠定了科学基础，也为全球畜禽资源保护提供了典型案例。

研究成果已于近期发表于国际学术期刊iScience。中国科学院昆明动物研究所博士研究生Lameck A. Odongo、坦桑尼亚索科因农业大学George M. Msalya博士、冈比亚西非家畜创新中心Olawale F. Olaniyan博士为共同第一作者；中国科学院昆明动物研究所 Adeniyi C. Adeola副研究员、彭旻晟研究员、张亚平研究员及崖州湾国家实验室韩建林首席科学家为共同通讯作者。